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科学家通过为DNA字母表添加新字母使数据存储的密度增
   https://www.fubuwang.com 2023-04-20 10:03:43
核心提示:跟大多数事物一样,自然界得数据存储系统--DNA远远超过了我们所创造得任何东西。现在,伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校得研究人员通

跟大多数事物一样,自然界得数据存储系统--DNA远远超过了我们所创造得任何东西。现在,伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校得研究人员通过在其“字母表”上增加额外得字母来将其令人难以置信得存储能力提高了一倍并开发了一种新得方法来读取它。

DNA是由四个核碱基得自然组合组成:腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶。这些碱基以字母A、G、C和T表示,以不同得序列组合在一起进而形成每个生物体得蓝图。而这种信息存储系统得密度令人难以置信,一克DNA能存储多达215PB(2.15亿GB)得数据。

这当然使它成为现代社会每天产生得大量数据得一个非常具有吸引力得潜在存储解决方案--互联网得全部内容都可以装在一个装满DNA得鞋盒里。并且,如果这种存储还不够密集得话,新研究得研究人员已经找到了一种将其加倍得方法。

除了通常得A、G、C和T之外,研究小组在DNA字母表中有效地增加了七个“字母”。这些字母采取化学改性核苷酸得形式开辟了更多不同得组并允许在相同数量得物理空间内存储更多得信息。

“想象一下英语字母表,”该研究得论文共同感谢分享Kasra Tabatabaei说道,“如果你只有四个字母可以使用,那么你只能创造出这么多单词。如果你有完整得字母表,你可以产生无限得单词组合。这跟DNA是一样得。我们可以将零和一转换为A、G、C和T,而不是将零和一转换为A、G、C、T及存储字母表中得七个新字母。”

当然,增加额外得核苷酸意味着现有得读取数据系统不会识别它们,所以该团队还开发了一个能识别得新系统。DNA链通过一个专门设计得蛋白质中得纳米孔来检测各个单元--无论它们是天然得还是合成得。然后机器学习算法对储存在其中得信息进行解码。

“我们尝试了11种核苷酸得77种不同组合,我们得方法能完美区分每一种,”该研究得论文共同感谢分享Chao Pan说道,“作为我们识别不同核苷酸得方法得一部分得深度学习框架是通用得,这使得我们得方法可以通用于许多其他应用。”

除了密度,新方法还提高了数据得写入速度,这通常是一个相当迟缓得DNA过程。这个系统约将向DNA写入信息所需得时间减半。

这项工作可能有助于使DNA成为一个可行得数据存储系统,当然在实现之前仍有大量得工作要做。

 
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